© Divers collecting leaves of Neptune grass (Posidonia oceanica) in the bay of Calvi in Corsica, (c) Christian Jogler
© Prof. Dr. Christian Jogler moved to the University of Jena just a few weeks ago. Here he holds the professorship for microbial interaction, (c) Anne Günther / FSU
© Leaves of the Giant Cane (Macrocystis pyrifera) off the coast of Monterey Bay, California. (c) Christian Jogler
© Neptungras (Posidonia oceanica) off the coast of Corsica. On this plant particularly many Planctomyceten were found, (c) Christian Jogler
Antibiotik dari laut
November 21, 2019
Tim peneliti membuka sumber antibiotik baru
Tim yang dipimpin Prof. dr. Christian Jogler dari Universitas Friedrich-Schiller Jena telah berhasil membudidayakan dan secara fungsional mengkarakterisasi beberapa lusin bakteri laut yang sampai sekarang terabaikan di laboratorium, sehingga bakteri tersebut dapat diakses untuk pemeriksaan sistematis. Analisis awal dan pengamatan biologis sel menunjukkan potensi produksi antibiotik baru.
Hampir tiga perempat dari semua antibiotik yang relevan secara klinis adalah produk alami – diproduksi oleh bakteri. Namun antibiotik yang tersedia saat ini kehilangan efektivitasnya, dan semakin banyak patogen yang resisten terhadap antibiotik tersebut. Antibiotik baru sangat dibutuhkan. Namun, saat ini kurang dari satu persen spesies bakteri yang diketahui tersedia untuk pencarian obat, 99 persen sisanya dianggap “tidak dibudidayakan” dan oleh karena itu hampir tidak dieksplorasi.
Kemampuan memproduksi antibiotik tidak merata di kalangan masyarakat. bakteri. “Yang terpenting, ini dapat ditemukan pada mikroorganisme dengan cara hidup yang kompleks, biologi sel yang tidak biasa, dan genom yang besar”, jelas Prof. Dr. med. Christian Jogler. “Organisme semacam itu menghasilkan senyawa antibiotik dan menggunakannya untuk memperebutkan nutrisi dan habitat melawan bakteri lain,” lanjut ahli mikrobiologi tersebut. "Di mana pun distribusi mikrobiologi sulit terjadi dan nutrisi langka - kami berasumsi ini adalah tempat yang menjanjikan untuk mencari produsen antibiotik potensial."
Inilah yang telah dilakukan Prof. Jogler dan timnya: dengan robot selam dan penyelam ilmiah, mereka telah mencari apa yang disebut Planctomycetes di sepuluh lokasi di laut. “Kita tahu bahwa Planctomycetes hidup dalam komunitas dengan mikroorganisme lain, dan bersaing dengan mereka untuk mendapatkan habitat dan nutrisi,” kata Jogler, menjelaskan alasan yang membuat kelompok bakteri ini menarik bagi para peneliti. Dari sampel dari Mediterania, Laut Utara, Laut Baltik, Laut Hitam, Samudra Atlantik, Pasifik, dan Samudra Arktik, para ilmuwan mampu membawa total 79 Planctomycetes baru ke dalam budaya murni. “Jika digabungkan, kultur murni ini membentuk 31 genera baru dan 65 spesies baru,” tambah Dr. Sandra Wiegand, penulis pertama studi tersebut.
Untuk mengkarakterisasi kultur murni yang baru diperoleh, metode bioinformatik dan mikroskopis digunakan. “Analisis bioinformatika dirancang secara holistik. Hasil analisis ini menunjukkan bahwa Planctomycetes yang baru ditemukan memiliki gaya hidup yang sangat kompleks dan berpotensi menghasilkan antibiotik baru,” kata Dr. Wiegand. Banyak aspek dari pekerjaan mereka saat ini, menurut penulis penelitian, akan dialihkan ke produsen antibiotik potensial lainnya.