Antibiotika fra havet

November 21, 2019 Forskerteamet åpner en kilde for nye antibiotika

Teamet rundt prof. dr. Christian Jogler fra Friedrich-Schiller-Universitetet Jena har lykkes i å dyrke og funksjonelt karakterisere flere titalls hittil forsømte marine bakterier i laboratoriet, noe som gjør dem tilgjengelige for systematisk screening. Innledende analyser og cellebiologiske observasjoner indikerer et potensial for produksjon av nye antibiotika.

Nesten tre fjerdedeler av alle klinisk relevante antibiotika er naturlige produkter - produsert av bakterier. Men antibiotikaene som er tilgjengelige i dag mister sin effektivitet, flere og flere patogener er resistente mot dem. Nye antibiotika er påtrengende. For øyeblikket er imidlertid mindre enn én prosent av de kjente bakterieartene tilgjengelige for legemiddelsøk, de resterende 99 prosent anses som "ukultiverte" og blir derfor knapt utforsket.

Evnen til å produsere antibiotika er ikke jevnt fordelt blant bakterie. "Fremfor alt kan det finnes i mikroorganismer med komplekse levesett, en uvanlig cellebiologi og store genomer", forklarer prof. Dr. med. Christian Jogler. – Slike organismer produserer antibiotikaforbindelser og bruker dem i kampen om næringsstoffer og habitater mot andre bakterier, fortsetter mikrobiologen. "Uansett hvor slike mikrobiologiske distribusjonskamper oppstår og næringsstoffer er knappe - antar vi at dette er et lovende sted å lete etter potensielle antibiotikaprodusenter."

Dette er nøyaktig hva prof. Jogler og teamet hans har gjort: med dykkerroboter og vitenskapelige dykkere har de søkt etter såkalte Planctomycetes på til sammen ti steder i havet. "Vi vet at Planctomycetes lever i samfunn med andre mikroorganismer, og konkurrerer med dem om habitat og næringsstoffer," sier Jogler og forklarer årsaken som gjør denne bakteriegruppen interessant for forskere. Fra prøvene fra Middelhavet, Nordsjøen, Østersjøen, Svartehavet, Atlanterhavet, Stillehavet og Polhavet klarte forskerne å bringe totalt 79 nye Planctomycetes inn i ren kultur. "Til sammen utgjør disse rene kulturene 31 nye slekter og 65 nye arter," legger Dr. Sandra Wiegand, førsteforfatter av studien, til.

For å karakterisere de nylig oppnådde rene kulturene ble bioinformatiske og mikroskopiske metoder brukt. "Bioinformatikkanalysen var holistisk utformet. Resultatene av disse analysene viser at de nyoppdagede Planctomycetes har eksepsjonelt kompleks livsstil og potensial til å produsere nye antibiotika," sier Dr. Wiegand. Mange aspekter av deres nåværende arbeid, ifølge forfatterne av studien, vil bli overført til andre potensielle antibiotikaprodusenter.