米原珊瑚礁位于石垣岛北部的川平点。这个地方只允许船只进入。平均深度为5至30米。在5到6米深的地方有一个珊瑚架，在20到25米的水面上下降到一个沙质区域，有三个根部，密布着台状和涡状珊瑚。

石垣市卡比拉的水晶海滩（山原海滩）是一个隐蔽的景点，这里有来自大本岳山河流的天然水晶沉淀物。这里未受污染的水域中栖息着珊瑚礁、热带鱼和海龟。由于需要通过一个陡峭的斜坡才能到达，且设施有限，因此必须做好准备工作并小心谨慎。

这个潜水点位于石垣岛的西北侧，是世界上与蝠鲼接触率最高的潜水点之一。乘船10至15分钟就可以到达。水深约为10-20米，潮水相对平静，但有时会变强。海水中间的一座小山是一个清洁站，蝠鲼会来这里参观。蝠鲼在5到10米深的地方游来游去，所以你可以通过浮潜看到它们。

蝠鲼城位于冲绳县石垣市卡比拉石崎蝠鲼争夺战（Kabira Ishizaki Manta Scramble）附近，是一个广受欢迎的潜水地点，拥有 5 米至 25 米的浅礁。这里是世界闻名的蝠鲼清洁站，乘船前往非常方便，是初学者观赏蝠鲼的理想地点。

苏库吉古鲁昆根位于石垣岛卡比拉地区近海，水深 10 米至 35 米，是一个广受欢迎的潜水点。这里的落差地形和水流使潜水充满活力，适合中级及以上水平的潜水者。

长浦珊瑚花园位于石垣的长浦湾，珊瑚种类丰富，水域平静，适合各种水平的潜水者。这里的能见度很高，最佳潜水季节是 5 月至 10 月。

石垣半岛（Ishigaki Peninsula）附近的天皇椅（Emperor's Chair）是一个深潜点（20-40 米），水流湍急，地形复杂。它以一个巨大的树根为中心，栖息着成群的蝴蝶鱼、犬牙金枪鱼（isomaguro）、拿破仑鱼、蝠鲼和侏儒海马--非常适合经验丰富的潜水员。

位于石垣西部卡比拉（Kabira）的酒井田大拱门（Sakieda Big Arch）拥有一个 3 米高的巨大拱门，可以容纳一艘船。阳光透过天花板的缝隙照射进来，形成了神奇的 "光雨 "效果。这里水流平缓，水深 12-20 米，非常适合初学者和有经验的潜水者。

冲绳石垣岛西部的崎枝田迷宫（Sakieda Maze）拥有复杂的珊瑚礁构造，天然拱门和隧道营造出神奇的光影效果。这里水深 3 至 15 米，水流平缓，适合初学者。浅水区有生机勃勃的珊瑚礁和小丑鱼等各种鱼类。

石垣岛西部的五神崎灯塔下地形复杂，水深 10 米处有大大小小的树根和迷宫般的水道。这里常见岩鳕等洄游鱼类，还有阳光照耀下的拱门和洞穴，是地形爱好者的最爱。