Three Sisters adalah tiga batu besar yang saling terhubung satu sama lain, semuanya ditutupi dengan karang, spons biru, dan penuh dengan kehidupan. Anda akan menyelam di bawah naungan arus dan menyelesaikan penyelaman di puncak-puncaknya yang masing-masing setinggi 6, 7, dan 8 meter. Anda mungkin cukup beruntung untuk melihat ikan pari melintas di atas puncak.

Pillarsteen memiliki dinding yang dramatis, lorong renang yang menakjubkan, dan karang cambuk yang besar. Lokasi penyelaman ini tidak memiliki tempat berlindung dari ombak Samudra Hindia, oleh karena itu, bersiaplah untuk menghadapi ombak besar. Saat ombak tenang, Anda dapat melihat makhluk makro yang fantastis, mulai dari apel laut hingga udang cambuk.

Batu Tiga terletak di kawasan tengah Taman Nasional Komodo. Ini adalah lokasi penyelaman tingkat lanjut karena biasanya arusnya kuat. Sorotan dari penyelaman ini mencakup habitat yang sangat baik untuk ikan besar seperti napoleon wrasse, kerapu, ikan selar raksasa, dan barakuda. Kedalaman maksimum adalah 35 meter.

Pantai Pink / Pantai Merah terletak di area tengah Taman Nasional Komodo. Kontur dasarnya landai dan terdiri dari campuran terumbu karang, puing-puing, dan vegetasi. Lokasi penyelaman ini cocok untuk semua tingkatan penyelam. Jenis terumbu karang tersebar dan terendam. Terdapat kedalaman maksimal 30 m.

Karang Makassar, atau yang lebih dikenal dengan nama Manta Point, adalah tempat menyelam terbesar di Taman Nasional Komodo dengan panjang sekitar 3km dan lebar 400-500m. Tempat ini merupakan lokasi penyelaman dangkal dengan terumbu karang yang indah di sebelah selatan, bukit-bukit pasir di sebelah utara, dan reruntuhan karang di antara keduanya, yang tersebar di beberapa tempat pembersihan manta.

Police Corner terletak di area tengah Taman Nasional Komodo. Topografi di sini meliputi tebing-tebing besar. Ini adalah lokasi penyelaman tingkat lanjut dengan arus sedang hingga kuat. Sorotan utama termasuk karang lunak dan keras yang indah. Kedalaman maksimum adalah 30 m.

Wainilu terletak di area tengah Taman Nasional Komodo. Topografinya terdiri dari lereng berpasir. Tempat ini lebih merupakan tipe penyelaman muck dive, bagus untuk mencari makhluk-makhluk kecil dan cocok untuk semua tingkatan penyelam.

Di Mawan ("indah" dalam bahasa lokal) terdapat stasiun pembersihan manta. Lokasi ini terletak di bagian tengah Taman Nasional Komodo. Topografinya terdiri dari lereng berpasir putih dengan taman karang dan terumbu karang tepi. Ini adalah lokasi penyelaman yang ramah untuk pemula. Kedalaman maksimum adalah 30 m.

Makassar Reef, alias Manta Point, terletak di area tengah Taman Nasional Komodo. Memiliki dasar reruntuhan dan merupakan tempat menyelam yang ramah bagi pemula. Kedalaman maksimum adalah 18 m. Situs ini dianggap sebagai penyelaman melayang.

Salah satu tempat menyelam kelas dunia. Cocok untuk penyelam tingkat lanjut dan/atau berpengalaman, karena arusnya yang kuat, Batu Bolong menawarkan beberapa kawanan ikan yang besar, banyak ikan pelagis dan berbagai jenis hiu di kedalamannya.