Three Sisters adalah tiga batu besar yang saling terhubung satu sama lain, semuanya ditutupi dengan karang, spons biru, dan penuh dengan kehidupan. Anda akan menyelam di bawah naungan arus dan menyelesaikan penyelaman di puncak-puncaknya yang masing-masing setinggi 6, 7, dan 8 meter. Anda mungkin cukup beruntung untuk melihat ikan pari melintas di atas puncak.

Secret Garden menawarkan pemandangan yang luar biasa bagi para penggemar makro dan mereka yang mencari spesies yang lebih besar. Dengan terumbu karang yang landai, di perairan dangkal, situs ini memiliki beragam jenis karang, ditambah karang lunak yang menjadi tempat tinggal kawanan ikan karang.

Pantai Pink / Pantai Merah terletak di area tengah Taman Nasional Komodo. Kontur dasarnya landai dan terdiri dari campuran terumbu karang, puing-puing, dan vegetasi. Lokasi penyelaman ini cocok untuk semua tingkatan penyelam. Jenis terumbu karang tersebar dan terendam. Terdapat kedalaman maksimal 30 m.

Batu Tiga terletak di kawasan tengah Taman Nasional Komodo. Ini adalah lokasi penyelaman tingkat lanjut karena biasanya arusnya kuat. Sorotan dari penyelaman ini mencakup habitat yang sangat baik untuk ikan besar seperti napoleon wrasse, kerapu, ikan selar raksasa, dan barakuda. Kedalaman maksimum adalah 35 meter.

Lorong Torpedo terletak di daerah selatan Taman Nasional Komodo. Kontur dasar lautnya berupa lereng yang datar. Komposisi dasar terdiri dari terumbu karang yang tidak merata, vegetasi, dan batu karang. Lokasi penyelaman ini cocok untuk semua level penyelam. Kedalaman maksimum adalah 20 m.

Batu Kanibal terletak di daerah selatan Taman Nasional Komodo. Topografinya berupa lereng yang landai. Lokasi penyelaman ini cocok untuk semua tingkatan penyelam. Ada kemungkinan terdapat arus panjang dan/atau arus bawah. Daya tarik utama dari lokasi penyelaman ini adalah karang lunak dan karang keras yang berwarna-warni, dengan banyak kehidupan makro. Kedalaman maksimum adalah 40 m.

Karang Makassar, atau yang lebih dikenal dengan nama Manta Point, adalah tempat menyelam terbesar di Taman Nasional Komodo dengan panjang sekitar 3km dan lebar 400-500m. Tempat ini merupakan lokasi penyelaman dangkal dengan terumbu karang yang indah di sebelah selatan, bukit-bukit pasir di sebelah utara, dan reruntuhan karang di antara keduanya, yang tersebar di beberapa tempat pembersihan manta.

Dinding kuning terletak di daerah selatan Taman Nasional Komodo. Kontur dasar terdiri dari campuran jurang dan lereng yang curam. Komposisi dasar adalah terumbu karang dan reruntuhan. Ini adalah lokasi penyelaman tingkat lanjut dengan arus sedang hingga kuat. Kedalaman maksimum adalah 40 m.

Lorong Manta terletak di bagian selatan Taman Nasional Komodo. Topografinya landai dengan komposisi dasar berupa terumbu karang, vegetasi, dan bebatuan. Lokasi penyelaman ini cocok untuk semua level penyelam. Ada kemungkinan besar terjadi kondisi ombak besar. Kedalaman maksimum adalah 40 meter.

Wainilu terletak di area tengah Taman Nasional Komodo. Topografinya terdiri dari lereng berpasir. Tempat ini lebih merupakan tipe penyelaman muck dive, bagus untuk mencari makhluk-makhluk kecil dan cocok untuk semua tingkatan penyelam.