Batu Tiga a Komodói Nemzeti Park központi részén található. Ez egy haladó szintű merülőhely, mivel általában erős áramlás van. A merülés fénypontjai közé tartozik a nagy halak, mint a napóleon wrasse, a csoportos sügér, az óriás trevally és a barracuda kiváló élőhelye . A maximális mélység 35 méter.

Karang Makassar, vagy Manta Point, ahogy ismertebb nevén Manta Point, a Komodo Nemzeti Park legnagyobb merülőhelye, amely körülbelül 3 km hosszú és 400-500 m széles. Ez egy sekély merülőhely, délre gyönyörű korallzátonyokkal, északra dűnékkel, a kettő között pedig törmelékes korallfenékkel, melyen elszórtan manta-tisztító állomások találhatók.

A Secret Garden nagyszerű tájat kínál mind a makro-rajongóknak, mind a nagyobb fajokat keresőknek. Az enyhén lejtős zátony a sekély vízben a korallbombák gazdag választékával büszkélkedhet, valamint a lágykorallok hatalmas zátonyhal-rajoknak adnak otthont.

A Három nővér három nagy szikla, amelyek mindegyike kapcsolódik egymáshoz, mindegyiket korallok, kék szivacsok borítják, és hemzsegnek az élettől. Az áramlat árnyékában merülünk, és a merülést a 6, 7 és 8 méteres csúcsokon fejezzük be. Szerencsés lehetsz, ha rájákat látsz a csúcsok tetején átkelni.

A Pillarsteen drámai falakkal, lenyűgöző átúszásokkal és hatalmas ostoros korallokkal büszkélkedhet. Ez a merülőhely nem védett az Indiai-óceán hullámaitól, ezért számítson hullámzásra. Ha a hullámzás csendes, fantasztikus makroállatokat figyelhetünk meg a tengeri almáktól az ostoros korall partner-garnélákig.

A leghíresebb "lyuk a sziklában" (az indonéz fordításból), Batu Bolong azért népszerű, mert itt található a legkülönfélébb tengeri élővilág és korallok, de azért is, mert a "Current City" szívében található.

Mawanban ("gyönyörű" a helyi nyelven) manta-tisztító állomások vannak. Ez a hely a Komodói Nemzeti Park központi részén található. A domborzat fehér homokos lejtőből áll, korallkerttel és peremzátonnyal. Ez egy kezdőbarát merülőhely. A maximális mélység 30 m.

A Makassar-zátony, más néven Manta Point a Komodói Nemzeti Park központi részén található. Törmelékes fenékkel rendelkezik, és kezdő búvárkodásra alkalmas. A maximális mélység 18 m. Ez a hely sodródásos merülésnek számít.

A Golden Passage a Komodói Nemzeti Park északi részén található. Ez egy lejtős hely, amelynek maximális mélysége 25 méter. Tapasztalt búvárok számára alkalmas hely, mivel az áramlási viszonyok általában erősek.

A Tatawa Kecil a Komodói Nemzeti Park központjában található. A merülőhely fénypontja a lágy- és keménykorallokból álló korallkert. Maximális mélység 30 méter. Ez a hely tapasztalt búvárok számára alkalmas, mivel az áramlási viszonyok erősek lehetnek.