Situé au large de la côte sud de Nusa Penida, Batu Bolong est le site de plongée autour de la célèbre arche qui est souvent photographiée. Il ne peut être plongé qu'à marée montante, lorsque la houle est faible, et est sujet à de forts courants et à des vagues.

Ce site de plongée est proche de la falaise qui présente un fort mouvement d'eau (surge). C'est un lieu de rassemblement pour les raies manta qui filtrent la nourriture collectée grâce à la pression des vagues du large.

Située sur le côté ouest de l'île de Nusa Penida, Crystal Bay possède deux formations de récifs coralliens séparées par des pentes de sable. La combinaison des pentes et des murs qui forment la topographie de ce site de plongée descend à plus de 50 mètres et rencontre de gros rochers qui sont un endroit idéal pour une station de nettoyage pour les poissons lune.

Cette grotte a une longueur horizontale d'environ 200 mètres où, à l'extrémité de la grotte, se trouve un grand espace ouvert habité par des chauves-souris. L'embouchure de la grotte se trouve à une profondeur de 8 mètres sous le niveau de la mer.

Situé au sud de l'île de Nusa Penida et faisant face à l'océan Indien, Labyrinth peut souvent avoir de grosses vagues. Ce site de plongée comporte un certain nombre de canyons et de passages et on peut souvent y voir passer des raies manta de récif qui se rendent soit à Manta Point à l'est pour se nettoyer, soit à Manta Bay à l'ouest pour se nourrir.

Une petite baie à l'ouest de Nusa Penida qui possède des coraux sains dans une zone plate peu profonde, suivie d'une pente qui atteint plus de 40 mètres. Un des meilleurs endroits pour observer le Mola mola, ou poisson lune océanique, à la bonne saison.

Située au sud de l'île de Nusa Penida et face à l'océan Indien, Manta Point peut souvent avoir de grosses vagues. Ce site de plongée possède de grands monticules rocheux qui sont souvent visités par les raies manta pour leur auto-nettoyage, d'où le nom de ce site.

Le rocher extérieur au sud-est de Manta Point, Nusa Penida. Avec ses vagues et ses courants, cette zone peut être un défi pour les plongeurs, mais elle peut aussi être si calme que vous pouvez nager tout autour du rocher.

Situé sur le bord est de Nusa Ceningan, cet impressionnant mur de plongée ne peut être plongé que pendant l'étale de marée haute lorsque les conditions le permettent. Dans le canal entre Nusa Ceningan et Nusa Penida, le site connaît de forts courants, ce qui explique l'impressionnante vie marine que l'on peut y observer.

Toyapakeh est connu comme l'un des meilleurs sites de plongée dans cette région. Il est situé dans un petit coin de l'embouchure nord du canal de Ceningan. Alors que les courants peuvent être forts et parfois imprévisibles, les plongeurs sont récompensés par certaines des plus belles structures coralliennes et la biodiversité marine que Penida a à offrir.