Un viaje en barco de 2 horas o más es la única forma de llegar al lugar de buceo Dry Tortugas. Este lugar tiene entre 10 y 65 pies de profundidad e incluye partes de arrecife y pecios.

Sand Key es un área de preservación de santuarios que originalmente era su propia isla. Debido a la erosión y a los huracanes, se ha reducido a un pequeño parche de arena rodeado por un arrecife de coral. La arena es una característica especialmente agradable que no suele tener en otros arrecifes de coral de Florida. Un gran lugar para bucear y hacer snorkel.

El arrecife Eastern Dry Rocks es un lugar popular para el buceo y/o el snorkel. También está bastante cerca de otros múltiples arrecifes como Sand Key y Rock Key, por lo que es común que los buzos y los aficionados al snorkel vean varios arrecifes en una sola salida.

Las grietas dentro del arrecife en Rock Key son más profundas y más amplias que las que se encuentran normalmente en otros arrecifes de coral. Estas aberturas más amplias crean el hábitat perfecto para el mero, la morena y otros peces de Florida.

Ball and Chain es uno de los arrecifes exteriores más históricos de Cayo Hueso. Se hizo famoso por los antiguos amarres caseros llamados Boyas Bubba que se utilizaban para amarrar barcos frente a Cayo Hueso para su cuarentena.

Cayo Cottrell es una de las tres islas de manglares situadas a 9 millas al noroeste de Cayo Hueso, dentro del Refugio Nacional de Vida Salvaje de Cayo Hueso. Es muy poco profunda e ideal para snorkelers. Es un vivero de muchas especies recién nacidas y juveniles y hogar de raros peces murciélago.

El Cable es uno de los lugares de buceo más emocionantes del arrecife exterior de Cayo Hueso. En la década de 1850 era el cable telegráfico que empezaba cerca de la boya de Southernmost Point y llegaba hasta La Habana, Cuba. A mediados de los años 80 fue desmontado por la ATT.

15 Minutos al sur de Key West, FL se encuentra el arrecife de 9 pies de estaca. Este arrecife se encuentra junto al arrecife Mile Marker 32. Este arrecife se encuentra en el sistema de santuario marino nacional de los Cayos de Florida; sin embargo, se permite la pesca y la pesca submarina.

Este es uno de los sitios de buceo más famosos de Cayo Hueso. Hundido hace más de 10 años, este Ex-Militar Rastreador de Misiles varía en profundidad de 70 pies a más de 100 pies y es sólo para buzos avanzados y expertos.

A 6 millas al sur de Cayo Hueso se encuentra el arrecife Marker 32. Este sitio se encuentra junto al arrecife Western Sambos. Este arrecife tiene dos bolas de amarre en él. Sitio de buceo muy fácil con formaciones de coral de estilo espolón y ranura.