Karang Makassar, tai Manta Point, kuten se tunnetaan paremmin, on Komodon kansallispuiston suurin sukelluskohde, joka on noin 3 km pitkä ja 400-500 m leveä. Se on matala ajelehtiva sukelluskohde, jonka eteläpuolella on kaunis koralliriutta, pohjoispuolella dyynit ja niiden välissä korallipohja, jossa on mantojen puhdistusasemia.

Pink Beach / Pantai Merah sijaitsee Komodon kansallispuiston keskeisellä alueella. Pohja on kalteva ja koostuu koralliriutan, raunioiden ja kasvillisuuden sekoituksesta. Sukelluskohde sopii kaikentasoisille sukeltajille. Koralliriuttojen tyypit ovat hajanaisia ja upottavia. Maksimisyvyys on 30 metriä.

Mawanissa ("kaunis" paikallisella kielellä) on mantojen puhdistusasemia. Tämä paikka sijaitsee Komodon kansallispuiston keskiosassa. Alueen pinnanmuodostus koostuu valkoisesta hiekkarinteestä, jossa on korallipuutarha ja reunariutta. Tämä on aloittelijoille sopiva sukelluskohde. Maksimisyvyys on 30 m.

Yksi maailmanluokan sukelluskohteista. Soveltuu edistyneille ja/tai kokeneille sukeltajille, sillä voimakkaiden virtaustensa vuoksi Batu Bolong tarjoaa syvyydessään valtavia kalaparvia, monia pelagisia kaloja ja erilaisia haita.

Secret Garden tarjoaa upeat maisemat sekä makroharrastajille että suurempia lajeja etsiville. Matalassa rinteessä on loiva riutta, jossa on runsaasti erilaisia korallipommeja ja pehmytkoralleja, jotka toimivat isäntänä valtaville riuttakalakannoille.

Tatawa Kecil sijaitsee Komodon kansallispuiston keskustassa. Tämän sukelluskohteen kohokohta on pehmeiden ja kovien korallien muodostama korallipuutarha. Suurin syvyys on 30 metriä. Tämä paikka sopii kokeneille sukeltajille, sillä virtaukset voivat olla voimakkaita.

Siaba Kecil sijaitsee Komodon kansallispuiston keskiosassa. Pinnanmuodostus koostuu ylängöistä ja korallipuutarhasta. Tämä on edistyneen tason sukelluskohde, sillä virtaukset ovat kohtalaisista voimakkaisiin. Tämän sukelluskohteen kohokohta on pehmeät ja kovat korallit. Suurin syvyys on 30 metriä.

Siaba Besaria kutsutaan myös nimellä Turtle Town, ja se sijaitsee Komodon kansallispuiston keskiosassa. Se on yleisesti ottaen aloittelijoille sopiva sukelluskohde, jossa on korallisaumoja, riuttoja ja hiekkapohjainen alue.

Police Corner sijaitsee Komodon kansallispuiston keskiosassa. Topografia sisältää valtavia ylityskohtia. Tämä on edistynyt sukelluskohde, jossa on keskivahva tai voimakas virta. Kohokohtiin kuuluvat kauniit pehmeät ja kovat korallit. Suurin syvyys on 30 metriä.

Kolme sisarta ovat kolme suurta kalliota, jotka ovat kaikki yhteydessä toisiinsa ja jotka ovat korallien ja sinisten sienien peitossa ja jotka kuhisevat elämää. Sukellat virran varjossa ja päätät sukelluksen 6, 7 ja 8 metrin korkeudessa olevilla huipuilla. Saatat onnekkaasti nähdä rauskut, jotka risteilevät huippujen huipulla.